L'Hôpital des Nounours est un des projets phares de la CNEM en collaboration avec la Faculté de médecine de Nantes qui existe depuis plusieurs années. Le but de cet événement destiné aux enfants de grande section est de reconstituer un hôpital et d'y inviter les enfants afin de faire soigner leur nounours "malade".
Ce projet permet surtout de faire connaître aux enfants le vaste monde médical et paramédical grâce à la collaboration avec de nombreux étudiants d'autres filières : pharmacie, dentaires, infirmiers, kinésithérapeutes, sages-femmes, orthophonistes, ostéopathes...
L'objectif est de familiariser les enfants au monde médical et de dédramatiser le monde de l'hôpital et l'effet "blouse blanche".